Dvärgflodhästen är vegetarian och de stora tänderna används när de behöver försvara sig. Den lever i närheten av fuktiga kärrmarker och är mest aktiv under eftermiddagen och kvällen. Dvärgflodhästens hud är väldigt känslig för uttorkning. Man skulle kunna säga att den har ett inbyggt solskyddssystem eftersom huden utsöndrar en löddrande vätska som fungerar ungefär som solskyddskräm så att huden inte torkar ut.